然而清代初叶又是西方某些科学技术得以引进的时期。其时，明代的许多著作被禁。徐光启、宋应星等因是明代官员，其所遗留下来的科学技术著作也在禁止之列；同时，许多汉族学者因排满情绪拒绝出仕，一时间科学技术方面颇为冷落。清朝统治者为此任用了许多西方传教士为其服务。康熙年间，因康熙帝个人对自然科学的爱好，促成了更多西方科学技术的传入，使始于明末的西学东渐潮流进入了一个高涨时期。在此潮流的影响下，中国的科学技术呈现了复苏气象。但由于这些科学技术活动受政治需要的限制，统治者也忌讳汉人与传教士的接触，因而当时的一些科学技术成果和许多西方科学技术知识最终成了宫廷垄断的专利品。在这一时期，传教士们带来的西方科学技术，有些被搁置起来，如火器制造技术。传教士们帮助制造的火炮在平定三藩以及抵抗沙俄侵略时还发挥过很大作用，至康熙中期，因无军事需要，便不再受到重视。而采矿技术，因统治者怕人民“聚众闹事”，私人开矿受到极严格的限制，传统技术也无以发展，当然更不需要什么外来技术了。又如西方人体解剖与生理学，康熙帝虽曾请传教士为其讲授过，但为维护传统道德和其自身统治利益的需要，经传教士译成满文的解剖学著作也就秘藏高阁而仅供御览。然而有些门类的科学技术，特别是像天文学和数学等，由于清代并不禁止民间研习，经过一些中国学者如王锡阐、梅文鼎等人的努力而被接受、吸收，并在不同程度上促进了中国科学技术在这方面的发展。